لاحظ تقرير ديوان الرقابة المالية والإدارية للعام 2019 و2020 عدم إجراء الوكالة التحاليل المختبرية على عينة من الخضروات والفواكه المستوردة عبر المنافذ الجمركية للتحقق من سلامتها للاستهلاك وخلوها من الآفات، والتنسيق مع الجهات المختصة لتنفيذ ذلك.

ولفت إلى أن ذلك الأمر لا يتيح التحقق من الالتزام بالمواصفات القياسية الدولية الصادرة عن وزير الصناعة والتجارة والسياحة، بشأن تبني مواصفات قياسية دولية خاصة بقطاع المنتجات الغذائية والزراعية واعتمادها كمواصفات قياسية وطنية.