عمومًا، اللقاحات آمنة وفوائدها تفوق الآثار الجانبية التي قد تترتب عليها، كما أن مخاطر الإصابة بالعدوى الميكروبية ومضاعفاتها أكثر من مضار التطعيم.

وفي الوقت الجاري قبل ترخيص اللقاحات، يتم عمل الدراسات والتجارب العلمية المتعلقة بفعالية اللقاحات وسلامتها وأمانها عبر الدراسات المخبرية والإكلينيكية وغيرها، كما يتم مراقبتها بعد الاستخدام في مختلف المجتمعات.